Twilight Imperium 3 ist ein klassisches Strategiespiel. Angefangen beim Aufbau des Universums, welches durch die Spieler selbst erstellt wird, über den Aufbau der Flotte, der Erforschung neuer Technologien und dem Erobern neuer Planetensysteme.
Allerdings gewinnt bei Twilight Imperium 3 nicht derjenige Spieler, der die meisten Siege erringt, sondern der, der die meisten Punkte über so genannte "Public und Private Objective Cards" erhält. Dies wird im Spiel häufiger vergessen und so kann es passieren, dass das kleinste Empire nachher gewinnt.